Ich hätte auch spontan auf Parasiten getippt, wenn alle drei vermehrt Hefen haben. Manchmal werden Kokis nicht nachgewiesen. Und Würmer im Kot zu finden ist oft Glückssache.
Für die bakteriologische Kotuntersuchung brauchst Du ganz normalen Kot, ob der nun auch über mehrere Tage gesammelt werden muss, weiß ich leider nicht.