Ich kenne es auch, gerade, wenn Tiere von Außen- in Innenhaltung kommen, daß sie einige Wochen Umgewöhnungszeit benötigen, um wieder die Kloecke zu finden.

Falls Deine Mäuse gezielt immer an eine bestimmte Ecke machen, würde ich dort ein Extra-Klo aufstellen. Ansonsten würde ich es auch so machen, wie bereits geraten: Decken austauschen mit Handtüchern, die man heißer waschen kann. Man kann auch diese Anti-Rutsch-Matten für Schreibtischstühle auslegen und darauf dann Klo / Handtücher / Decken, die rutschen nicht weg und es geht nichts auf den Boden. Handtücher ins Klo gelegt zum Umgewöhnen habe ich nie, meistens werden die Tiere nach einigen Wochen Orientierung auch so wieder stubenrein.