So wie du das Verhalten von Nala schilderst und auch das Sitzen im eigenen Urin, würde ich schon darauf schließen, dass ihr irgendetwas fehlt. Und das lässt sich leider nur durch Untersuchungen beim TA herausfinden.

Kaninchen merken ja sehr viel schneller, dass mit ihren Artgenossen etwas nicht in Ordnung ist. Und dann kommt es auch oft zur Änderung der Rangordnung. So könnte ich mir auch das geänderte Rollenverhalten bei deinen beiden erklären.