Ich finde nicht, dass es nach einem untypischen EC-Verlauf klingt. Schau mal in diesem Thread, da hatte eine Häsin auch gelähmte Hinterläufe durch EC. http://kaninchenschutzforum.de/showthread.php?t=87006
Mittlerweile geht es ihr wieder gut, die Behandlung hat gut angeschlagen.
Die EC-Erreger müssen nicht immer im Kopf sitzen, was dann zu der typischen Kopfschiefhaltung führt, bei einer Lähmung der Hinterläufe können sie sich auch im Rückenmark ausgebreitet haben.

Ich würde auch röntgen lassen, um Verletzungen o.ä. auszuschließen.